MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 44995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020833	CAACC	2	10	31556	31565	40 %	0 %	0 %	60 %	472332544
503	NC_020833	CT	3	6	31665	31670	0 %	50 %	0 %	50 %	472332544
504	NC_020833	TAT	2	6	31796	31801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332544
505	NC_020833	T	6	6	32074	32079	0 %	100 %	0 %	0 %	472332545
506	NC_020833	CCG	2	6	32113	32118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332545
507	NC_020833	GCG	2	6	32317	32322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332545
508	NC_020833	TGG	3	9	32543	32551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332546
509	NC_020833	TAC	2	6	32594	32599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332546
510	NC_020833	CAG	2	6	32613	32618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332546
511	NC_020833	TGTT	2	8	32651	32658	0 %	75 %	25 %	0 %	472332546
512	NC_020833	TGT	2	6	32783	32788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332546
513	NC_020833	ATTA	2	8	32922	32929	50 %	50 %	0 %	0 %	472332546
514	NC_020833	CTTG	2	8	33006	33013	0 %	50 %	25 %	25 %	472332547
515	NC_020833	CAA	2	6	33112	33117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332547
516	NC_020833	TTC	2	6	33160	33165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332547
517	NC_020833	TC	3	6	33198	33203	0 %	50 %	0 %	50 %	472332547
518	NC_020833	GCG	2	6	33277	33282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332547
519	NC_020833	CGG	2	6	33308	33313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332547
520	NC_020833	GAT	2	6	33351	33356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332547
521	NC_020833	ACC	2	6	33361	33366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332547
522	NC_020833	ATG	2	6	33517	33522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332547
523	NC_020833	TGG	3	9	33544	33552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332547
524	NC_020833	AGA	2	6	33597	33602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332547
525	NC_020833	CATTT	2	10	33609	33618	20 %	60 %	0 %	20 %	472332547
526	NC_020833	TTG	2	6	33640	33645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332547
527	NC_020833	ATT	2	6	33652	33657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332547
528	NC_020833	GGT	2	6	33661	33666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332547
529	NC_020833	TGTT	2	8	33737	33744	0 %	75 %	25 %	0 %	472332547
530	NC_020833	GGC	2	6	33786	33791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332547
531	NC_020833	AGT	2	6	33807	33812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332547
532	NC_020833	GGCT	2	8	33844	33851	0 %	25 %	50 %	25 %	472332547
533	NC_020833	GAT	2	6	33873	33878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332547
534	NC_020833	TAT	2	6	33951	33956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332547
535	NC_020833	TGG	2	6	34016	34021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332547
536	NC_020833	AGGC	2	8	34025	34032	25 %	0 %	50 %	25 %	472332547
537	NC_020833	ACC	2	6	34092	34097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332547
538	NC_020833	ATG	2	6	34183	34188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332547
539	NC_020833	TAC	2	6	34196	34201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332547
540	NC_020833	TGT	2	6	34202	34207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332547
541	NC_020833	TTC	2	6	34213	34218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332547
542	NC_020833	ATT	2	6	34365	34370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332548
543	NC_020833	CGC	2	6	34488	34493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332548
544	NC_020833	A	6	6	34495	34500	100 %	0 %	0 %	0 %	472332548
545	NC_020833	ATT	2	6	34509	34514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332548
546	NC_020833	GCA	2	6	34516	34521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332548
547	NC_020833	AAATT	2	10	34535	34544	60 %	40 %	0 %	0 %	472332548
548	NC_020833	GAT	2	6	34584	34589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332548
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550	NC_020833	TGAT	2	8	34670	34677	25 %	50 %	25 %	0 %	472332548
551	NC_020833	TTA	2	6	34744	34749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332548
552	NC_020833	ACCA	2	8	34870	34877	50 %	0 %	0 %	50 %	472332548
553	NC_020833	GGC	2	6	34912	34917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332548
554	NC_020833	AACC	2	8	35046	35053	50 %	0 %	0 %	50 %	472332548
555	NC_020833	GTG	2	6	35074	35079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332548
556	NC_020833	AAG	2	6	35144	35149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332548
557	NC_020833	ATC	2	6	35194	35199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332548
558	NC_020833	AGC	2	6	35259	35264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332548
559	NC_020833	ATT	2	6	35313	35318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332548
560	NC_020833	A	6	6	35320	35325	100 %	0 %	0 %	0 %	472332548
561	NC_020833	TTTAA	2	10	35429	35438	40 %	60 %	0 %	0 %	472332549
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564	NC_020833	TGC	2	6	35568	35573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332549
565	NC_020833	CTC	2	6	35689	35694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472332549
566	NC_020833	TGAT	2	8	35727	35734	25 %	50 %	25 %	0 %	472332549
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572	NC_020833	A	6	6	36266	36271	100 %	0 %	0 %	0 %	472332549
573	NC_020833	GCA	2	6	36536	36541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332550
574	NC_020833	CAT	2	6	36542	36547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332550
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576	NC_020833	ATG	2	6	36577	36582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332550
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582	NC_020833	AG	3	6	37238	37243	50 %	0 %	50 %	0 %	472332550
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588	NC_020833	CAG	2	6	37719	37724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332550
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591	NC_020833	ATT	2	6	37860	37865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332550
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594	NC_020833	A	6	6	38007	38012	100 %	0 %	0 %	0 %	472332550
595	NC_020833	CAAA	2	8	38219	38226	75 %	0 %	0 %	25 %	472332551
596	NC_020833	ATCAA	2	10	38228	38237	60 %	20 %	0 %	20 %	472332551
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598	NC_020833	TATC	2	8	38256	38263	25 %	50 %	0 %	25 %	472332551
599	NC_020833	TG	3	6	38327	38332	0 %	50 %	50 %	0 %	472332551
600	NC_020833	ATT	2	6	38342	38347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332551
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602	NC_020833	TTGTG	2	10	38490	38499	0 %	60 %	40 %	0 %	472332551
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610	NC_020833	GTG	2	6	39080	39085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332551
611	NC_020833	CAA	2	6	39122	39127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332551
612	NC_020833	A	6	6	39242	39247	100 %	0 %	0 %	0 %	472332551
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621	NC_020833	CAAC	2	8	39583	39590	50 %	0 %	0 %	50 %	472332552
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